Kudou Shinichi egy igazi zseni. 17 évesen már számos megoldhatatlannak tartott bűntényt oldott meg, s ezzel kiérdemelte Japán legjobb nyomozójának címét.
Egyik nap osztálytársával, gyerekkori barátjával és szerelmével Mouri Rannal elmegy a vidámparkba, ahol épp megoldott egy bűntényt, majd hirtelen fura alakokra lett figyelmes. Követni kezdi őket, ám a fickó társa elkapja, s egy ismeretlen eredetű szert adnak be neki. Shinichi ennek következtében összement, s úgy néz ki, mint régi 10 éves önmaga, ám az esze semmit sem változott.
Mivel szülei külföldön vannak, s senkit nem akart belerántani ebbe az ügybe, csakis szomszédjához, Agasa professzorhoz fordult, aki elhatározta, hogy találmányai segítségével segíteni fog a fiún, hogy ő megtalálhassa azokat az embereket, akik beadták neki a szert. Ám ekkor megjelenik Mouri Ran, s Shinichi, hogy ne lepleződjön le, egy távoli rokonnak adja ki magát Edogawa Conan néven. Conan, vagyis Shinichi Ranékhoz költözik a reményben, hogy mivel Ran apja magánnyomozó, így könnyebben nyomra bukkanhat majd.
Csakhogy Mouri Kogoro nem éppen a legjobb nyomozók egyike, s Conannak kell mindent bűntényt megoldani, elindítva ezzel Alvó Kogoro „legendáját”.
Vajon sikerül megtalálnia a Fekete Ruhás fickókat, s visszanyernie régi külsejét? Sikerül-e addig rejtve maradnia a külvilág irányában, vagy leleplezik? És vajon hogyan sikerül egyszerre két szerepet eljátszania, hogy Ran se legyen kétségbeesett és szomorú?
Minden kérdésre megkapjátok a választ, ha megnézitek a sorozatot:)